本发明公开了一种考虑多阶段恢复过程的综合能源系统韧性提升方法，具体步骤如下：首先，构建灾前准备阶段模型；其次，构建灾害袭击阶段模型，识别灾害发生后综合能源系统中的故障与非故障区域；随后，构建故障隔离阶段模型，缩小故障区域面积；然后，构建基于网架快速重构的供能恢复阶段模型，实现非故障区域用户的供能恢复；最后，采用逐步对冲算法将原模型分解为一系列可并行求解的故障场景子模型，实现模型的高效快速求解。本发明从灾前主动防御、灾后故障快速隔离与供能恢复角度出发，提出了一种考虑多阶段恢复过程和多能流协调的综合能源系统韧性提升方法，为韧性综合能源系统的极端灾害应对能力建设提供了理论基础。