本发明公开了一种基于胺基芴骨架的快速及长时间溶酶体或细胞核靶向的近红外染色试剂及其制备方法和应用，本发明以胺基芴骨架作为溶酶体或细胞核染料的基础，通过不同形式的烷基胺的调控设计，得到基于胺基芴骨架的溶酶体或细胞核靶向的近红外染色试剂，该类试剂在快速靶向染色的同时，具有超高的稳定性，有利于长时间监测，同时具有较好的生物相容性，不会对活细胞的生理活动产生明显的干扰。由于该染色试剂具有超大斯托克斯位移的特性，在进行生物成像时，基本不会受到激发光所造成的成像干扰，使得该类染料具有高信噪比成像的优势。本发明的制备方法收率高、反应条件温和，制得的染色试剂稳定性好、发射波长较长、斯托克斯位移大、靶向性高。