本发明公开了一种集成北斗和视觉的基础设施结构形变测量方法及系统。分别在第一时刻和第二时刻通过相机拍摄全部靶标，得到第一成像图和第二成像图，其中，相机位于目标设施上，全部靶标两两成对，且每一对靶标位于目标设施的一个局部区域；根据第一成像图和第二成像图，确定每一对像点的像点相对距离变化量，其中，一对像点与一对靶标对应；获取相机在第一时刻和第二时刻之间的位移数据，根据位移数据对每一像点相对距离变化量进行校正，得到校正后的像点相对距离变化量；根据每一校正后的像点相对距离变化量，确定每一局部区域的结构形变数据。本发明采用了相机的位移数据进行误差平差，可以解决现有结构形变测量方法误差较大的问题。