本发明公开了基于双种群粒子群法的闪电三维定位方法，涉及闪电定位领域，包括S1获取各个测站的闪电电场信号；S2对闪电电场信号进行去噪过滤获得预处理后的电场信号；S3每个测站预处理后的电场信号与其他测站电场信号进行脉冲匹配获得脉冲组合；S4将所有匹配好的脉冲组合进行解算得到初始的闪电三维定位结果；S5采用双种群粒子群法优化拟合初始的闪电三维定位结果获得最优的闪电三维定位结果作为最终定位结果；采用混沌分布的全局搜索种群协同多样性搜索粒种群对闪电定位初始结果进行优化拟合，能够降低对初始解精度的依赖，避免结果“早熟”，甚至结果发散的情况；同时也可以提高计算效率，提升计算精度。