本发明涉及一种管材侧孔加工系统，包括定位组件；定位组件包括承接槽、顶撑件和限位盘；顶撑件在承接槽内部往复移动；限位盘设置在承接槽远离顶撑件的一端；限位盘位于顶撑件移动轨迹的延长线上；限位盘朝向顶撑件的一侧表面设置有卡槽；卡槽中心处设置有嵌块；卡槽与待加工管材的端部镶嵌配合；嵌块对应镶嵌填充在待加工管材的内部；通过限位盘与顶撑件相互配合将该待加工管材夹持住，限位盘依靠摇臂和多个孔位结合调整配合位置，可以兼容更多尺寸的管材，同时利用限位盘卡槽内的气囊结构增强了对管材的定位能力。