本公开的实施例涉及在外部工具中的高速调试延迟补偿。一种测试工具，包括时钟生成电路，生成测试时钟以及经由测试时钟输出焊盘输出测试时钟；数据处理电路装置，由测试时钟计时；以及数据输出电路装置，接收从数据处理电路装置输出的数据以及经由输入/输出(IO)焊盘输出数据，数据输出电路装置由测试时钟计时。测试工具也包括可编程延迟电路，生成测试时钟的延迟版本；以及数据输入电路装置，接收经由IO焊盘输入的数据，数据输入电路由测试时钟的延迟版本计时。测试时钟的延迟版本被延迟，以补偿在经由测试时钟输出焊盘向外部计算机传输测试时钟的脉冲与经由IO焊盘接收从外部计算机输入的数据之间的延迟。