本发明涉及水利工程领域，尤其涉及一种深孔地质勘探钻机；所述深孔地质勘探钻机包括：钻井支架、抬升结构、钻孔结构、固定结构；所述钻机支架设置供钻孔结构进行抬升的滑轨，所述钻机支架左右两侧边设置开口槽，且开口槽贯穿钻机支架；用于将钻孔结构进行抬升的抬升结构设置在钻井支架的后置电机放置板上；用于对地质进行钻孔取样的钻孔结构设置在钻机支架上，并通过电机腔内壁底侧的开口伸出；用于在钻孔结构进行钻孔取样时对整体钻机进行固定限位的固定结构设置在钻机支架的开口槽内，本发明提供一种利工程建设用的深孔地质勘探钻机具有较高灵活性的优点。