本发明公开了一种基于Java探针技术的柔性分布式事务中心系统，包含：分布式事务客户端和分布式事务服务端；分布式事务客户端包含Java探针监控模块、SQL分析模块、日志记录模块和本地事务回滚模块；分布式事务服务端包含事务注册模块、全局事务回滚模块和分支事务驱动模块。通过Java探针监控模块对服务的接口进行监控，记录各服务之间接口的调用链和调用状态，保存各接口执行之前以及执行之后的数据库快照，生成探针日志，用于回滚操作。本发明所提供的基于Java探针技术的柔性分布式事务中心系统，通过探针取代拦截器或是切面的方式实现代码的低侵入，不需要修改用户代码即可通过修改字节码的方式达成接入系统的特性。