本发明公开了一种基于核局部线性嵌入PLS的复杂工业过程运行状态评价方法，包括离线建模、在线评价和非优原因追溯。首先使用KLLEPLS算法建立离线模型，该模型不仅能够提取与综合经济指标(CEI)相关性最大的特征，而且能够保持数据的局部非线性结构；然后针对过程强非线性关系提出一种新的在线评价方法，通过计算在线数据特征与离线建模数据特征之间的相似性，制定有效的评价规则，实现在线数据的实时评价；当评价结果非优时，根据提取的在线数据计算变量的贡献率，确定非优原因变量。本发明有效解决了现有评价方法在强非线性过程提取特征信息不全面的问题，从而使评价结果更准确，保障了生产产品的质量。