本发明公开了一种鱼类多样性调查采样装置，包括围网结构、水下拍摄装置和逆流泵，所述围网结构包括合围网段、分层网段和防鱼回流段，所述分层网段包括底层围网、中层围网和上层围网，所述防鱼回流段包括下斜网和上翘网，所述水下拍摄装置包括水下高清摄像头和服务器，所述水下高清摄像头包括前端摄像头和尾端摄像头，所述分层网段的每层网段的前端侧边均设有一个前端摄像头，所述防鱼回流段的每层网段的尾端均设有一个尾端摄像头，所述逆流泵设置在离防鱼回流段后端10‑15米位置。本发明利用围网对分层的鱼拍摄，每层鱼被该层内的前端摄像头和尾端摄像头拍摄到，并传输到服务器进行统计分析，不影响鱼的自然生长，统计准确度高、统计效率高。