本发明涉及医疗器械，公开了一种多功能穿刺器、手术系统及其使用方法。多功能穿刺器包括呈两端开口状的穿刺套管、与穿刺套管连接的套管接头和穿刺针，穿刺套管内形成有排抽通道、输液通道和输气通道，套管接头上设置有与排抽通道连接的穿刺针通道，穿刺针可拆卸地插接在穿刺针通道和排抽通道内，穿刺套管上远离套管接头的一端设置有与排抽通道连接的排烟结构、与输液通道连接的喷液孔和与输气通道连接的喷气孔，套管接头上设置有与穿刺针通道连接的排烟控制件、与输液通道连接的喷液控制件以及与输气通道连接的喷气控制件。本发明提供的穿刺器能够实现自动同步排烟、对镜头喷液和喷气进行自动清洁的功能。