本发明提供了一种治疗心血管的纳米载体缓释制剂及其制备方法，由己酮可可碱纳米载体冻干粉、药用辅料组成。所述己酮可可碱纳米载体冻干粉，己酮可可碱和纳米载体的重量比为4～5:1；所述纳米载体材料为壳寡糖‑脱氧胆酸‑白蛋白的组合物，其中壳寡糖、脱氧胆酸与白蛋白的重量比为1∶2‑3∶3.0‑3.3；所述己酮可可碱和药用辅料的重量比为（4‑7）∶1，所述的药用辅料由羟乙基纤维素、微粉硅胶、硬脂酸镁组成，其中羟乙基纤维素、微粉硅胶、硬脂酸镁的重量比为（5‑6）:（3‑4）:1。本发明提供的治疗心血管的纳米载体缓释制剂溶出速度平稳，基本呈零级线性溶出，避免了突释，大大保证了己酮可可碱的治疗效果，不良反应显著降低；在加速条件下放置6个月，降解产物含量低，质量稳定。