一种类DNA分子双螺旋多层曝气搅拌系统，包括至少一组由气源驱动装置和搅拌装置构成的曝气搅拌装置，其中所述的搅拌装置包括至少一个搅拌单体；每个搅拌单体整体呈中空的类DNA分子双螺旋结构，包括搅拌轴、覆盖有打孔膜片的搅拌杆和固定杆，搅拌轴具有进气孔，多层搅拌杆的外侧通过固定杆连接成类DNA分子双螺旋结构形状，搅拌杆中部与搅拌轴连通，两端设有带打孔膜片的喷头，搅拌杆的单侧以及喷头的同侧都布设出气孔A，最下方的搅拌杆下方另外还开设出气孔B；打孔膜片的孔眼设置在搅拌杆和喷头同侧且与出气孔A不相重合。本发明能充分曝气，具有稳定高效加强的多层搅拌效果，可以对池体下方死角的充分曝气扰动，达到彻底处理污水的目的。