本发明涉及一种模块化多层次时间序列深海沉积物孔隙流体采样器及方法，包括贯入探杆，贯入探杆在最上端套管内顶部设置有耐压仓，耐压仓顶面嵌入安装有两个水密接插件，连接件包括柱状体和凸设于柱状体中部的环形凸台，柱状体的中心开设有贯穿的信号传输通道，柱状体在信号传输通道的周向开设有贯穿柱状体上下面的孔隙流体通道，且孔隙流体通道的上下端分别螺纹连接有敞口的采样瓶，环形凸台上开设有与孔隙流体通道连通的固定通道，固定通道内安装有控制阀门且环形凸台在固定通道口嵌入安装有金属过滤器，控制阀门的导线接口设置在信号传输通道内并通过导线与总控系统电连接。本发明基于蓝牙通讯技术，可实现大容量、高保真及高效样品采集。