本发明提供了一种柔性冲剪孔控制系统，属于冲剪孔相关领域，该系统包括主控模块、与所述主控模块电性连接的供电模块、与主控模块双向电性连接的定位模块、供油模块、驱动模块、推动模块、冲孔模块和报警模块，以及与主控模块输出端双向电性连接的显示模块；本发明避免了每次手动通过示教器进行示教，操作麻烦的问题，便于产品尺寸的调整，降低了工作人员的劳动强度，同时系统智能程度较高，便于管理。