本发明公开了一种水质在线监测系统及方法，系统包括：经取样接入口依次连接的过滤器、反应器、澄清器、采样器和检测仪，过滤器用于对高浓度浆液进行过滤处理，以去除悬浮物避免管路堵塞；反应器与澄清器，用于对干扰离子进行药剂预处理，以屏蔽悬浮物、干扰离子对离子测定的影响；设置有与反应器连接的药剂箱、与检测仪连接的试剂箱；纯水储罐和压缩空气储罐，连接于过滤器和反应器之间的管路上，且纯水储罐还与采样器相连，纯水储罐存储用于向反应器中注入纯水；压缩空气储罐用于对管路进行吹扫；数据分析与控制模块，与检测仪和纯水储罐相连，用于基于检测仪的水质监测信息进行水质在线监测，以及控制纯水储罐向反应器内注水以进行稀释处理。