本发明涉及一种医疗废物自清洁灭菌桶，包括一用于装载医疗废物的桶体和用于封闭桶体的桶盖，桶盖包括桶盖架、两个半板和两块翻板，两块半板设置在桶盖架的两侧，两个翻板设置两个半板之间，翻板中部设置有一翻转转轴，翻转转轴两端分别连接在两块半板上，使得翻板旋转，中心轴上还设置有限位器，翻板的两端分别开设有清理槽，清理槽内设置有一清理转轴，清理轴外侧设置有破碎挤压辊；通过两个翻板上的破碎挤压辊配合使用，对进入桶内的医疗废物进行穿刺和破碎从而使得桶内的医疗废物能够露出更大表面积，从而将医疗废物内部的细菌和病毒暴露出来，进入灭菌桶内更好的被消灭，另一方面将医疗废物破碎避免了不法人士对医疗废物的非法利用。