本发明涉及一种仓储转运AGV顶升定位系统，包括AGV小车、货架和工位，AGV小车上安装有多个柔性升降装置，柔性升降装置包括支撑组件、气囊和罩壳，支撑组件包括底座，底座上固定有多个立柱，多个立柱上固定有台板，气囊的底部固定在台板上，罩壳与气囊的顶部固定连接，罩壳的上侧设有定位台，罩壳的下端固定有限位环，限位环的内壁上下端对应设有第一锥面和第二锥面，台板设有与第一锥面配合的第三锥面，立柱的下端设有与第二锥面配合的圆台，货架的支撑板的下侧面设有与定位台配合的定位孔，货架的支腿的下端设有定位头，工位包括与支腿对应设置的四个定位块，定位块设有与定位头配合的定位槽。其具有结构简单、控制方便、适应性强、可靠性高的优点。