本发明公开了一种工程机械软件维护方法及系统，所述方法包括基于功能需求，构建出软件层次聚类模型；基于修改请求，以及所述软件层次聚类模型，检索出相应的软件代码实体；基于检索出的软件代码实体，维护所述层次聚类模型。本发明能够简化维护人员理解软件、分析程序、再执行修改工作的过程，节省了大量的人力成本和时间，为软件维护提供了便捷有效的方法和方向。