本发明公开了一种海水天然珍珠的培育方法，包括以下步骤：S1、将珍珠贝壳表层打磨干净，制成贝壳粉末，消毒，得到贝壳粉，备用；S2、选择个体大，壳缘生长线正常，贝体强壮，生活力旺盛，贝龄为1.5—2龄的珍珠贝作为培育贝；S3、将培育贝钻孔，得到注射孔，将贝壳粉喷入培育贝壳顶部体内外套膜结缔组织内；S4、将已喷入贝壳粉的培育贝壳顶向上，进行暂养和休养，休养期结束后，得到育珠贝，将育珠贝移到育珠海区养殖1年以上，待珍珠养成，即可收集海水天然珍珠。本发明提供的培育方法可在同一个珍珠贝上同时培育传统有核珍珠和海水天然珍珠，具有更高的经济效益，而且操作过程均在珍珠贝体外操作，方法简单，操作容易，成效显著。