本发明涉及一种双层多频点聚焦透镜超表面阵列，属于人工电磁领域。该聚焦透镜超表面阵列，包括“工”字形离散单元和双“T”形离散单元；每个离散单元包括两层单层单元结构和空气介质层；每个离散单元从上至下包括第一金属片、第一介质板、第二金属片、空气介质层、第三金属片、第二介质板和第四金属片；所述聚焦透镜超表面阵列是平面结构，沿xoy坐标水平放置。本发明的双层多频点聚焦透镜超表面阵列单元结构采用电容耦合臂结构作为金属层，单元覆盖的带宽更宽，相对于传统超表面透镜能减少一层介质的堆叠。利用两种不同的离散介质单元结构对透射相位进行调节，相对于传统相移单元设计更加灵活，对电磁波的操控精度更高。