本发明公开了一种提高地衣芽胞杆菌芽胞形成效率的方法，属于芽胞杆菌芽胞的制备领域。本发明发现柠檬酸具有调控芽胞形成效率的新功能，柠檬酸能缓解细胞的氧化胁迫，并可使芽胞形成过程中阻遏spo0A表达的abrB基因的表达量大幅下降。本发明方法为在发酵培养地衣芽胞杆菌的过程中加入柠檬酸，将柠檬酸作为代谢调控因子来使用，显著促进了芽胞的形成效率。本发明具有补料成分更简单、明确、原料易购、成本低、补加方法明确、操作可控性高、适用于发酵生产等优点。