本发明公开一种气体扩散电极及其制备方法、以及燃料电池，气体扩散电极包括基底层和微孔层，微孔层的材质包括碳材料和疏水聚合物，微孔层包括第一微孔层和第二微孔层，第一微孔层位于第二微孔层和基底层之间，第一微孔层中，疏水聚合物的质量为碳材料质量的40～60％；第二微孔层中，疏水聚合物的质量为碳材料质量的20～35％。通过对第一微孔层和第二微孔层中的疏水聚合物的含量的设计，在微孔层中构建了合理的疏水聚合物含量梯度，使气体扩散电极在维持良好的导电性的同时，排水能力好，将其应用于燃料电池时，能将燃料电池反应中生成的水分更迅速的从微孔层中排出，从而防止水淹现象的发生，进而提高了燃料电池的性能、增加了其使用寿命。