本发明涉及一种岩层中垂直顶升取排水管预处理方法，首先，通过GPS配合全站仪对清障换填区域进行精确定位，船舶抛锚固定；再利用旋挖钻机对基岩进行套管切削；采用浮吊提升大抓斗将块石取出置于运输船上运抵指定位置，在套管内进行换填黄沙和粘土；待换填完成后，采用垂直顶升装置将管节逐节顶升，直至预定位置；顶升节全部就位后，利用船舶将取水格栅运抵取水头安装位置，潜水员水下安装取水头。本发明解决了垂直顶升工艺在岩层中无法实施的难题，同时清障完成下部采取优质粘土、黄沙换填的做法，避免了单纯换填粘土随风浪冲刷造成损失和单纯换填黄沙易引发隧道内垂直顶升渗漏风险；同时也规避了在隧道底部进行岩层处理的施工难度及风险。