本发明提供了一种自适应的工业设备数据采集方法及系统，方法包括以下步骤：将采集服务器与待采集的工业设备连接；在所述采集服务器设置有设定网关，所述设定网关用于调取与所述工业设备的通信协议匹配类型的通信协议；所述采集服务器根据所述匹配类型的通信协议采集所述工业设备的全量数据；通过预设的数据智能清洗程序对所述全量数据进行脏数据和坏点的清洗过滤，以获取所述全量数据的有效数据，所述有效数据通过时间序列数据库存储；所述有效数据通过隔离网关进行安全过滤后传输给转发服务器，所述转发服务器向上级服务器传输所述有效数据。利用上述方法能够适应各种工业设备的数据采集，保证了数据的可靠性、连续性、实时性。