本发明涉及电机模拟器中的建模精度技术领域，公开了一种永磁同步电机高精度建模方法、设备及存储介质，S1：基于车用永磁同步电机的电磁特性，建立交直轴磁链关于交直轴电流及转子位置角的电磁模型；S2：基于车用永磁同步电机的热特性，推导出电机内部损耗及温度变化的热模型；S3：将电磁模型与热模型通过损耗进行正向传导，通过电流、电阻进行逆向传导，建立面向电机模拟器的磁热耦合模型；S4：将磁热耦合模型应用在基于FPGA平台的电机模拟器中验证磁热耦合模型的准确性。基于本发明所建立的磁热耦合模型的电机模拟器，在满足实时运算单元运算能力约束的条件下，充分考虑了真实电机非线性电磁特性和热特性，有效地提高了电机模拟器的输出端口模拟精度。