本发明涉及一种用于小动物生理指标检测的辅助装置及其使用方法，包括支撑结构和支撑于所述支撑结构上的装置主体、弹性尾根固定组件以及尾巴套置管，所述装置主体采用透明材料制成，能够方便多角度观察和记录小动物的实时状态，所述装置主体还设置有底部开口，既方便小动物的尾巴能够自然伸出又方便实时收集小动物的排泄物，所述弹性尾根固定组件采用开放式弹性固定的方式固定小动物，使得小动物能够在所述装置主体内保持安静稳定状态，从而避免小动物产生应激反应和自由打转，进而避免各类连接在小动物身上的设备连线产生缠绕或断开连接，所述尾巴套置管能够保持在一定的温度范围内，既方便小动物的尾巴舒适放置又方便实验采样操作。