本发明实施例公开了一种间歇式铝卷退火炉在线控制系统和方法，包括：数学模型计算模块和铝卷温度实时修正模块连接到在线监测模块，线监测模块通过各测量电偶连接到铝卷退火炉；在线控制系统的控制方式包括：数学模型计算模块实时计算铝卷温度场，在线监测模块通过布设在铝卷高温点位置上的铝卷测温热电偶获取铝卷高温点位置的实测铝卷温度值，铝卷温度实时修正模块通过判断数学模型计算误差对计算得到的铝卷温度场进行实时修正。本发明实施例提供的技术方案解决了现有“差温加热”的铝卷控温方法，存在较高的铝卷超温的风险，难以保证铝卷退火质量，以及无法发挥退火炉最大生产效率等问题。