本发明公开了基于旋转磁场的磁性粒子动态磁泳分离装置和方法，涉及磁性粒子和磁性标记生物分子分离分析技术领域，本发明发明了斜形下线槽三相绕组动态磁泳分离装置，提出了磁性粒子磁场力牵引分离方法。利用斜形下线槽三相绕组旋转磁场对磁性粒子产生磁场力沿载液流动方向的分力，牵引不同特性的磁性粒子磁泳分离。磁性粒子分离的主要动力直接来自其所受旋转磁场磁场力的分力，磁场力从以前磁场分离方法中磁性粒子分离的辅助者，变成磁泳分离的主导者。进而，由于磁场力对磁性粒子粒径的敏感性高于载液推力，有利于粒子分离。因此，本发明提出的基于旋转磁场的动态磁泳分离装置和方法，能够有效提高磁性粒子的分离效果和分辨率。