本发明涉及一种船舶齿轮箱基座焊接垫片钻孔定位方法，该方法包括以下步骤：S1、将齿轮箱吊入舱内，调节齿轮箱在齿轮箱基座上方的位置，对齿轮箱进行定位并临时固定；S2、在齿轮箱底座的螺栓孔内安装定位套，将定位套插入齿轮箱底座螺栓孔内，所述定位套外壁贴合螺栓孔内壁，所述定位套中心设有贯穿定位套的孔；S3、将洋冲杆插入定位套的孔中，洋冲杆外壁贴合孔的内壁，通过洋冲杆在齿轮箱基座上端的焊接垫片上敲出样冲点；S4、吊离齿轮箱，以洋冲点为中心对焊接垫片钻孔。通过本发明的钻孔定位方法可以较为准确的进行钻孔定位，可以保证焊接垫片的钻孔中心和齿轮箱底座的螺栓孔的中心同心，为后续齿轮箱的安装精度提供了保障。