本发明公开了一种基于无影灯的可见光照明和近红外荧光手术导航系统。本发明基于LED无影灯，高亮度近红外荧光探针，近红外宏观成像系统。该系统通过使用LED无影灯，在提供术者可见光照明的同时，避免近红外波段背景光淹没荧光信号，使用高亮度的近红外荧光探针实现无影灯激发荧光，使用高灵敏度、低噪声近红外相机获取高信号背景比的荧光图像，使用显示装置实时显示近红外荧光图像，实现手术导航。本发明避免了像其他近红外荧光手术导航系统一样使用额外光源作为激发光，避免了对眼睛的可能的损害，简化了照明的结构并降低了成本。本发明性能可靠，使用简单，在导航手术中具有广阔的前景。