本发明涉及一种轨道交通全自动模式下火灾及断电联动扣车管理方法，该方法为：当信号系统收到来自于综合监控的火灾或失电信息时，信号系统将在上一站对列车进行扣车，防止列车进入火灾或弓网冲突区域；其中扣车具体结合列车所在位置及列车运行计划，在保证列车运营安全的前提下，尽可能降低故障场景带来的影响，做出信号系统联动扣车的最优解。与现有技术相比，本发明具有提高了线路运行效率，从而提高了乘客的舒适性以及安全性等优点。