本发明公开一种芯块自动排长装置和燃料棒生产系统，芯块自动排长装置包括推杆机构、芯块储存机构、排长机构、控制机构、芯块转运机构，芯块储存机构用于储存芯块，排长机构包括导板以及夹持组件，导板上的凹槽的输入端与芯块储存机构相接，推杆机构用于将各个芯块推送至凹槽内，多个芯块排列成芯块列，控制机构包括控制器、测长组件和夹持组件，测长组件用于测量导板上的芯块列的长度，并将长度值发送给控制器，控制器与夹持组件电连接，用于在接收到测量长度值时将之与设定长度值进行比较，并在测量长度值等于设定长度值时，控制夹持组件将芯块列的各个芯块分别夹持至芯块转运机构。所述装置自动化程度高、测量精度高。