本发明属于建筑工程技术领域，具体涉及一种柔性防水卷材光伏屋面板结构，包括防水结构、支撑结构以及数个光伏屋面板，相邻光伏屋面板之间的间隙通过硅酮结构密封胶密封；防水结构包括位于屋顶表面的防水卷材；支撑结构包括第一支撑组件与第二支撑组件，第一支撑组件用以支撑数个光伏屋面板，第二支撑组件用以支撑屋顶与防水卷材。本发明光伏屋面板和灌硅酮结构密封胶组成了上层保温隔热防水层，而下层的保温隔热防水层通过自攻螺钉将防水卷材固定在屋顶表面，本发明采用了两重防水结构，实现两重保温隔热，同时也能转化太阳能为建筑物提供电能，节能环保。