本发明涉及分子生物学技术领域，具体涉及一种寡核苷酸链随机拼合方法。本发明提供的随机拼合方法为以磁珠为载体，采用用于寡核苷酸链随机拼合的引物组，将n条寡核苷酸链中的任意k条寡核苷酸链随机拼合为长链寡核苷酸。该方法能够以较高的效率将短链寡核苷酸随机拼合为长链寡核苷酸，通过降低合成核苷酸随机序列的长度，更好地保证短链寡核苷酸中核苷酸的随机性和序列的多态性，而后再通过随机拼合来达到目标寡核苷酸链的长度。由此构建的长链寡核苷酸库和随机肽库具有较大的库容，且多态性较高，具有较好的应用前景。