本发明提供一种刷写汽车软件的方法及系统，涉及汽车软件刷写技术领域，包括：在生产过程中获取汽车的生产订单，生产订单中包括整车特征值、多个零部件号和订单生成时间；根据订单生成时间和各零部件号获取生产订单关联的待刷写控制器号，以及待刷写控制器号关联的待刷写软件号、待刷写软件版本、生效时间；根据整车特征值获取各待刷写软件号关联的待刷写配置字；根据待刷写软件号、待刷写软件版本、生效时间和待刷写配置字获取待刷写控制器号关联的软件数据包，以对待刷写控制器号对应的控制器进行软件刷写。有益效果是够基于单个生产订单进行软件数据包的匹配刷写，保证刷写软件版本受控且最新，实现软件定义汽车，具备较高的灵活性。