本发明公开了一种车载健康智能健康防护系统，涉及汽车智能控制领域，包括检测传感器、消毒器件和车辆控制器，检测传感器用于对车内温度以及车内人员体温进行检测；消毒器件用于对车内环境进行消毒；车辆控制器用于当车辆启动后，驱使检测器件工作，以及基于检测器件的检测结果，当车内人员体温异常时，则待车辆进行锁车后驱使消毒器件工作。本发明对消毒器件采用智能化的控制方案，对车内人员的健康状态进行检测，并根据车内人员的健康状态决定是否对车内进行消毒处理，同时确定合适的消毒时机，同时避免频繁使用消毒器件而造成车内零部件加速老化。