本发明公开了一种电动式曲轴箱通风系统，包括车辆控制器，车辆控制器的输入端连接有发动机转速传感器、发动机负荷传感器、发动机温度传感器、活塞漏气流量计、行驶里程传感器和存储器，所述车辆控制器的输出端连接有曲轴箱离心机。本发明还公开了一种电动式曲轴箱通风系统的控制方法，当发动机转速大于零时，获取发动机转速和发动机负荷，根据发动机转速和发动机负荷得到离心机目标转速，控制曲轴箱离心机实际转速等于离心机目标转速；当发动机转速为零时，控制曲轴箱离心机继续运行并降低离心机目标转速，直到发动机温度等于环境温度。本发明根据不同的工况提供合适的离心机转速，提高曲轴箱油气分离的效果同时降低离心机的能耗。