本发明涉及一种适用于水下复杂地质情况的无底套箱围堰的施工方法，包括以下步骤，套箱拼装：利用既有建筑上搭建的临时拼装平台，将若干壁板拼装，形成单独的套箱；套箱下放：在施工平台上，利用悬挂下放机构，通过起吊吊起套箱，利用驱动机构，驱动套箱，以设定间距为一次下放动作，通过若干次的下放动作，将套箱插入下放至预定位置；浇筑：利用导管法，对下放至底部的套箱进行浇筑，使其形成封闭式的围堰结构；既有桩基的割除：浇筑的围堰结构达到预定强度时，分段逐步割除既有建筑中的钢护筒，并清理钢护筒内以及围堰内的杂质；套箱的拆除：采用振动锤将拉森钢板桩拔除，待墩柱出水后，可进行钢套箱围堰拆除。本发明施工方法简单，效率高。