本发明公开了一种藿香正气软胶囊的制备方法，原料配比按照药典规定的藿香正气软胶囊的处方，包括以下步骤：a)陈皮的提取；b)苍术的提取；c)厚朴的提取；d)白芷、茯苓的提取；e)生半夏的提取；f)大腹皮的提取；g)制剂。本发明将传统藿香正气软胶囊中的每一味药材分别提取，根据不同药材的性质采用不同的方法提取方法，使得陈皮、苍术、厚朴、白芷、茯苓、生半夏、大腹皮中有效成分的提取率大大提高，再进行混合制成制剂，其质量易于控制。本发明在对每一味药材分别提取的同时，还能够有效除去苍术中的苍术苷和生半夏中的有害刺激成分，使得本发明制备得到的藿香正气软胶囊对心脑血管的疗效更佳。