本发明公开了一种针对rPPG信号中运动干扰的自适应滤波方法及系统，方法包括：拍摄被测对象脸部的视频，并利用人脸识别算法对视频帧进行人脸识别；对识别的人脸取像素平均值，得到RGB三个通道各自的平均的皮肤颜色信号；将RGB三通道的皮肤颜色信号进行色度处理得到一个单通道包含脉搏波的rPPG信号；对提取到的rPPG信号进行信号预处理，包括信号去趋势和带通滤波；通过提取人脸特征点在连续视频帧中的位移得到相应的运动信号；利用运动抑制的自适应滤波器去除rPPG信号中因被测对象运动引起的信号变化。本发明提出的rPPG信号自适应滤波方法可以有效地提高在剧烈运动场景下rPPG信号的信噪比。