本发明公开了一种生物医药提取装置及其提取方法，具体包括：防护筒，以及安装在所述筒状主体内腔底部中间位置的提取箱，以及安装在所述顶板中间位置的贯穿筒，且安装在所述顶板顶部且位于所述贯穿筒背面的驱动器，以及安装在所述贯穿筒上方的回收装置所述提取箱包括：提取筒，以及设置在所述无盖筒体内腔的搅拌辊，且安装在所述搅拌辊顶部的端盖，以及开设在所述端盖中间位置的进出口，且设置在所述端盖外表面的摩擦栓球，以及安装在所述端盖底部且位于所述搅拌辊外侧的密封罩，本发明涉及生物医药技术领域。通过搅拌辊将生物医药进行搅拌混合，使得生物医药进行混合搅拌，避免提取时产生生物医药原液因沉淀分层导致提取的不够彻底，确保提取的彻底性。