本发明提供了一种雨污管网溯源追踪系统及方法，包括雨污管网可视化模型、水质检测单元、云模块系统和GIS平台，将雨污管网构建包括四级管路系统的雨污管网可视化模型，水质检测单元的总检模块和分检模块根据预设频率上传检测数据至云模块系统，基于地理信息系统，可应用于各类环境影响评价的现状调查、预测分析环节，通过以地理信息系统为依托，提取往期高精度、强有力而可靠的水质监测数据，计算水体污染物排放量，分析水环境负荷，进行水环境影响预测与评价，能够快速、可靠获取污染物排放溯源信息。本发明增加了现状数据的真实性、便捷性，提高了水环境影响预测与评价效率。