本发明提供一种全自动生化检测仪，包括清洗机构、反应杯模块；清洗机构包括相连的第一驱动组件、清洗组件；反应杯模块包括第二驱动组件、保温室、若干透光的反应杯；若干反应杯嵌设于保温室内；清洗组件的若干清洗部与若干反应杯中心线在同一平面；检测前，第二驱动组件驱动反应杯往复运动以晃荡待检样本；清洗时，第一驱动组件驱动清洗组件垂直运动，第二驱动组件驱动反应杯水平运动。通过设计清洗组件、反应杯的相对运动关系，使得清洗机构的垂直运动配合反应杯模块的水平运动，以满足自动化清洗需求的同时有利于检测仪本体的小型化设计。反应杯模块的运动结构的设计，还可晃荡起到摇匀的作用，功能多样化，结构简单化。