本发明公开了一种漩涡式水质在线监测传感器清洗系统，解决现有水质监测传感器易被生物污染和杂质堵塞导致检测数据不准确的技术问题。本发明包括浮球和设于浮球内的旋涡清洗罐，旋涡清洗罐内设有清洗腔，旋涡清洗罐一侧壁安装有敏感元件端位于清洗腔内的水质监测传感器、另一侧壁连接与水质监测传感器相对应的漩涡清洗机构、底壁连接有用于监测进水的双泵进水机构、背部连接用于监测出水的排水机构。本发明结构简单、设计科学合理、使用方便，可定时对传感器进行一对一的高压漩涡式清洗，既保证了水质监测数据的稳定性和可靠性，又延长了监测设备使用寿命。