本发明公开了一种深水承台矩形钢板桩围堰结构及其施工方法，涉及围堰施工技术领域，现提出如下方案，包括L型配重底座，所述L型配重底座底部两端均焊接有垂直分布的定位杆，所述L型配重底座一侧外壁沿倾斜方向焊接有对称分布的第一加强杆，且L型配重底座一侧外壁沿倾斜方向焊接有对称分布的第二加强杆。本发明在矩形钢板桩的背部设有弧形缓冲板，利用弧形缓冲板与缓冲弹簧的相互配合，可以有效降低水体流动给矩形钢板桩连接处所带来的冲击，从而避免连接处晃动，可以增加内部密封性能，并且矩形钢板桩两侧设置可拆卸的拼接钢件，当一侧出现变形密封性降低时，可以对其进行更换，在维持较好的密封性同时，也能够降低维护成本。