本发明提供一种生态水环境综合检测设备及其使用方法。所述生态水环境综合检测设备，包括：用于控制设备运行以及完成生态水环境综合检测作业的控制柜；防护结构，所述防护结构设置于所述控制柜的顶部。本发明提供一种生态水环境综合检测设备及其使用方法，通过设置防护结构，主要用于对控制柜顶部起到防护作用，则通过传感器组件、控制柜以及转动电机之间的配合作用，能够实现转动板的转动，将光伏发电组件转动时底部位置，避免与外部雨水、冰雹等物质直接接触，进而对其进行很好的保护，同时转动板与防护棚上的导流件正好组合在一起，构成一体的导流板结构，使得光伏发电组件不再产生阻碍，而转动板上的雨水等物质快速被导出。