本发明公开了一种蓝靛果忍冬杂交授粉的方法，包括以下步骤：采集父本上刚开放1天的花，将雄蕊暴露伸出的花朵放置在培养皿中，放置在室内剪取花药放置在培养皿上阴干,将得到的花粉常温保存1‑3天；选取发育健壮的枝条上未开放、雌蕊未外露的花作为授粉母体对象，蓝靛果忍冬的花柱在花苞内逐渐生长，将花苞顶开之前，剪去雄蕊,只留下雌蕊；制作授粉工具，用橡皮粘取花粉给雌蕊授粉；授粉后套上硫酸纸袋，并观察果实发育进程，15天摘掉硫酸纸袋，换成网袋，等待果实成熟后脱落到纸袋里。本发明采用上述一种蓝靛果忍冬杂交授粉的方法，改进了授粉中部分操作环节，提高了授粉的工作效率，提高了蓝靛果忍冬座果率，改良了果实和种子的品质。