本发明公开一种局部放电信号奇异点滤除方法及系统，包括：获取局部放电信号序列；获取局部放电信号序列的中位数、下四分位数和上四分位数；对上四分位数与下四分位数之间的局部放电信号数字量求取平均值和标准差，根据平均值、标准差与中位数判断上四分位数与下四分位数之间的区间分布，根据判断结果更新上四分位数与下四分位数；根据更新后的下四分位数和上四分位数，得到阈值上限值和阈值下限值，并以此确定待滤除的奇异点。针对采样局部放电数据时存在的采集到不定数量极端值的问题，通过对四分位法的上、下四分位数进行位置更新，有效解决极端值数据影响有效数据段选取准确性的问题。