本发明公开了一种模式动物无麻醉定向包埋方法及其系统，该系统包括斑马鱼微流控芯片和液滴阵列芯片，所述斑马鱼微流控芯片包括微流控芯片基片和盖片；所述微流控芯片基片和盖片以非永久性结合的方式连接。所述微流控芯片仅需要简单的降温冷却即可以实现斑马鱼胶囊的制备，得到的斑马鱼胶囊与无固定斑马鱼的活力无差异，成活率高。所述斑马鱼无麻醉定向包埋药物筛选系统构建简单，系统小型化，使用方便成本低，无需外围设备辅助，药物筛选实验用量从mL级降低至μL级，实现了真正意义上的高通量、多表型、低消耗。